Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Uhrf1Q8VDF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Uhrf1Q8VDF2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Uhrf1Q8VDF2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Uhrf1Q8VDF2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Uhrf1Q8VDF2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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