Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdsQ8VBT2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms