Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf183Q8QZS5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf183Q8QZS5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf183Q8QZS5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf183Q8QZS5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Rnf183Q8QZS5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Rnf183Q8QZS5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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