Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms