Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms