Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9949Q8C9F4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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