Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ifi27Q8C6G0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms