Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NcaphQ8C156 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NcaphQ8C156 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcaphQ8C156 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NcaphQ8C156 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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NcaphQ8C156 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NcaphQ8C156 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms