Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp5Q8BX09 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms