Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik4Q8BMF5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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