Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms