Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Dsg1bQ7TSF1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Dsg1bQ7TSF1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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