Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms