Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ckap2lQ7TS74 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms