Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nphp3Q7TNH6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms