Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms