Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms