Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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