Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ccdc18Q640L5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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