Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms