Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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