Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde3bQ61409 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms