Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms