Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam220aQ3ZN08 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms