Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms