Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpr55Q3UJF0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms