Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rnf180Q3U827 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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