Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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