Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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