Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms