Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms