Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms