Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms