Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HmgcrQ01237 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms