Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms