Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TgfbiP82198 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms