Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsc22d1P62500 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsc22d1P62500 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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