Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms