Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms