Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms