Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms