Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NodalP43021 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NodalP43021 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NodalP43021 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NodalP43021 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NodalP43021 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NodalP43021 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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