Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Tnfsf9P41274 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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