Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mmp9P41245 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms