Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VhlP40338 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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