Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrgP28705 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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