Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc6P23475 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms