Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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