Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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