Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Me1P06801 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Me1P06801 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Me1P06801 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms